Na początku Mszy św. administrator parafii św. Anny w Krakowie, ks. Kazimierz Panuś serdecznie powitał kard. Grzegorza Rysia. Podkreślił, że celebracja wpisuje się w szczególny charakter miejsca, gdzie – jak mówił św. Jan Paweł II – „wiedza i mądrość szuka przymierza ze świętością”. Poprosił metropolitę o umocnienie wspólnoty Słowem Bożym, Eucharystią i pasterskim błogosławieństwem

W homilii kardynał nawiązał do Ewangelii, w której Jezus przychodzi do Nazaretu, żeby nauczać. – Jezus przychodzi tam, gdzie się wychował. Św. Hieronim tłumaczy to jako nutritus, czyli „wykarmiony”. Nazaretem, do którego dziś przychodzi Jezus jest alma mater – „matka żywicielka, matka karmicielka” – zaznaczył. Zauważył, że Jezus przybył do Nazaretu z poczuciem zobowiązania wobec wspólnoty, która Go wyżywiła. – Ta liturgia nas wzywa, żebyśmy to Jezusowe poczucie wdzięczności odnaleźli w sobie wszyscy – mówił. – Odnajdźcie w sobie wdzięczność do tej Matki żywicielki, jaką jest uniwersytet. Nie zamieńcie tego nigdy na takie poczucie: „To mnie uniwersytet powinien być wdzięczny, bo ja przecież tyle wysiłku i trudu własnego zainwestowałem” – prosił i stwierdził, że żądania wdzięczności i doceniania wysiłków naukowych mogą być przepełnione pychą. – Jezus przychodzi nauczać w miejscu, o którym może powiedzieć, że to jest „moja matka karmicielka”. I wszystko co robi, robi w jakimś głębokim doświadczeniu wdzięczności – podkreślił.

Wskazał, że słowa Jezusa niosły ze sobą nie tylko mądrość, ale także moc, siłę i łaskę. – Dla jednych ta łaska jest łaską odzyskania ponownie wzroku, właściwego widzenia. Dla innych ta łaska jest doświadczeniem wyzwolenia, wolności. Jeszcze dla innych ta łaska jest łaską poskładania kogoś, kto był połamany – zauważył kardynał, podkreślając że na łaskę może otwierać tylko ktoś, kto znajduje się w mocy Ducha. – Jeśli nasze nauczanie ma dawać ludziom doświadczenie łaski, to każdy z nas najpierw potrzebuje żyć w mocy Ducha – podkreślił i przypomniał, że mocą Ducha jest miłość.

W dalszej części homilii metropolita krakowski przywołał słowa św. Jana, który mówił, że kochając Boga, kocha się także ludzi. – Nauka, którą uprawiacie, zbiera Was we wspólnotę? Czy jesteście tylko gronem ludzi, którzy potrafią ze sobą rywalizować? – pytał zebranych w Uniwersyteckiej Kolegiacie św. Anny w Krakowie. – Kościół nie potrzebuje uniwersytetu jako zespołu ekspertów. Jest potrzebna wspólnota ludzi, którzy są zebrani wokół prawdy, potrafią do niej iść razem – zaznaczył, przywołując słowa przysięgi doktorskiej, w myśl której nauka uprawiana jest z miłości.

Kardynał wskazał, że „ostatecznie prawdą zawsze jest osoba”. – Prawda ostatecznie jest osobą w Ewangelii. Prawda jest osobą w chrześcijaństwie. I tu widać, jak ta miłość jest kluczowa. Ona jest nie tylko motywem. Ona jest nie tylko inspiracją – zauważył. – Osobę się poznaje przez miłość. Osoby się nie poznaje tylko w ten sposób, że się wszystko o niej przeczyta. Prawdziwe poznanie osoby dokonuje się w relacji, w spotkaniu miłości – dodał i stwierdził, że miłość nadaje sens nauce. – Bardzo wszystkim serdecznie życzę, byśmy odnajdywali w sobie Jezusa, który w mocy Ducha przekazuje słowa łaski – zakończył.

Podczas uroczystych promocji akademickich rektor ks. prof. dr hab. Robert Tyrała przypomniał, że historia Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II wyrasta z miłości do Boga i człowieka – od erygowania Wydziału Teologicznego w 1397 roku, przez powołanie Papieskiej Akademii Teologicznej przez św. Jana Pawła II, aż po utworzenie uniwersytetu w 2009 roku. Podkreślił, że misją uczelni jest łączenie zdobywania wiedzy z formacją serca, odpowiedzialnością za prawdę i służbą Kościołowi oraz Ojczyźnie. – Eminencjo, nasz drogi Wielki Kanclerzu. Kiedyś jako student, potem doktorant oraz pracownik naszej Alma Mater stajesz dziś pośród nas jako ojciec i przewodnik. To dla naszej akademickiej społeczności wielki dzień i wielka radość. Niech ten moment rodzenia się nowych pracowników nauki, którego dziś jesteśmy świadkami, będzie dla Ciebie nie tylko symbolicznym powrotem do domu, do Twojej uczelni, ale będzie też znakiem jedności biskupa krakowskiego z jego uniwersytetem – zwrócił się do kard. Grzegorza Rysia.

Następnie wręczono dyplomy doktorskie, habilitacyjne oraz profesorskie. Nowi doktorzy, doktorzy habilitowani i profesorowie reprezentują kilka wydziałów uczelni, podejmując w swoich badaniach zagadnienia z zakresu teologii, filozofii, historii, nauk społecznych oraz komunikacji społecznej i mediów.

Na Wydziale Teologicznym stopień doktora uzyskali: ks. dr Paweł Sułko oraz dr Joanna Matyja-Dudek. Na Wydziale Filozoficznym promocje doktorskie odebrali: dr Natalia Pietraszek i dr Sylwia Psica. Na Wydziale Historii i Dziedzictwa Kulturowego stopień doktora otrzymali: dr Joanna Karolina Adamczyk, dr Katarzyna Matyja, dr Hermina Święch-Małysa oraz dr Mateusz Zimny. Na Wydziale Nauk Społecznych w dyscyplinie socjologia promocje doktorskie objęły: dr Justynę Bieniarę-Woźnicką, dr Martę Michałek, ks. dr. Dariusza Nawarę, ks. dr. Wojciecha Paula, ks. dr. Jana Przybockiego oraz dr Urszulę Pułczyńską-Kurek. Na Wydziale Nauk o Komunikacji stopień doktora uzyskali: dr Agata Paszek, dr Joanna Skrzymowska oraz dr Maria Szajny. Stopień doktora habilitowanego otrzymali: dr hab. Jadwiga Skrzypek-Faluszczak (filozofia), dr hab. Hans Joachim Greif (nauki o rodzinie) oraz dr hab. Katarzyna Wojtanowicz (nauki o rodzinie). Podczas uroczystości wręczono również tytuły profesora UPJPII. Otrzymali je: prof. dr hab. Katarzyna Pokorna-Ignatowicz z Wydziału Nauk o Komunikacji oraz ks. prof. dr hab. Piotr Kroczek z Wydziału Prawa Kanonicznego, który w imieniu wszystkich promowanych wyraził wdzięczność metropolicie krakowskiemu.