Święty Jan Paweł II podczas swej ostatniej pożegnalnej pielgrzymki do Ojczyzny konsekrował ołtarz w nowej świątyni i dokonał Aktu zawierzenia świata Miłosierdziu Bożemu, 17 sierpnia 2002 r. we wspomnienie liturgiczne św. Jacka Odrowąża, misjonarza, patrona m. Krakowa i archidiecezji krakowskiej. Ta niezwykła uroczystość odbyła się w Krakowie – Łagiewnikach w trzecią sobotę miesiąca zwaną misyjną.

    W tym roku Sobota Misyjna przypadła 19 sierpnia. W tym szczególnym dniu i miejscu, w bazylice Miłosierdzia Bożego pielgrzymi modlili się za misje i w papieskiej intencji na sierpień: „Aby Światowe Dni młodzieży w Lizbonie pomogły młodym ludziom wyruszyć w drogę, żyć Ewangelią i być jej świadkami we własnym życiu”. W modlitwie prosiliśmy również o kanonizację bł. O. Jana Beyzyma SJ, posługacza Trędowatych na Madagaskarze, którego św. Jana Paweł II beatyfikował 18 sierpnia 2002 r. na Błoniach Krakowskich prosząc w czasie homilii: „W duchu miłosierdzia wspierajcie nieustannie misjonarzy pomocą i modlitwą”.

    Modlitwę rozpoczęto w Godzinie Miłosierdzia o 15.00 Koronką do Miłosierdzia Bożego, do której rozważania przygotował ks. dr hab. Bogdan Zbroja, z Papieskiego Uniwersytetu Jana Pawła II w Krakowie i sprawujący posługę w Światowym Centrum Kultu Miłosierdzia Bożego w Krakowie – Łagiewnikach. Na zakończenie tej modlitwy został odmówiony Akt zawierzenia świata Miłosierdziu Bożemu. Następnie sprawowana była Eucharystia, której przewodniczył ks. Ignacy Moskwa, a homilię głosił ks. dr Maciej Będziński, dyrektor Krajowy Papieskich Dzieł Misyjnych w Polsce.

    Na ołtarzu obecne były relikwie św. Jana Pawła II, św. S. Faustyny i bł. O. Jana Beyzyma. Podczas Mszy św. organistka, która jest studentką Akademii Muzycznej, zaśpiewała fragment pieśni o bł. O. Janie Beyzymie pt. „Dlaczego śpieszysz” (tekst i muzyka - ks. prof. Stanisław Ziemiański SJ). Prezes Towarzystwa Przyjaciół Trędowatych im. bł. O. Jana Beyzyma Elżbieta Jastrzębska przeczytała lekcję w czasie Mszy św. ( to ta sama osoba, która czytała lekcję podczas Mszy św. na Błoniach Krakowskich 18.08.2002 r.).

    W tym świętym miejscu w Krakowie - Łagiewnikach pielgrzymi z Polski i z całego świata modlą się za misje i w papieskich intencjach w każdą trzecią sobotę miesiąca zwaną misyjną podczas Koronki do Miłosierdzia Bożego i Eucharystii, od 1992 roku. Na początku, przez 10 lat ta szczególna modlitwa odbywała się w kaplicy klasztornej Sióstr, w której znajduje się łaskami słynący obraz Jezusa Miłosiernego z podpisem „Jezu ufam Tobie” oraz grób i relikwie św. S. Faustyny. Ta priorytetowa modlitwa to duchowe dziedzictwo św. Jana Pawła II, apostoła Miłosierdzia Bożego i misjonarza świata.